元代（1206——1368），真寧仍屬寧州。山河、太昌、早社3鎮(zhèn)及定平、襄樂(lè)2城歸寧州直轄。

明代（1368——1644），前期仍襲舊制，直至萬(wàn)歷二十九年（1601），經(jīng)邑人趙邦清提請(qǐng)，朝廷改真寧縣直屬慶陽(yáng)府，寧州不再領(lǐng)真寧縣。真寧縣轄郭下、長(zhǎng)樂(lè)、望仙、文樂(lè)、樂(lè)興、平子、西峪、路上、香廟、中廟、長(zhǎng)城、移豐、山河、新莊、萬(wàn)益、萬(wàn)盈、安夫、要冊(cè)、勾仁、安興、煙村21里。

清代（1616——1911）。初期沿襲明制。順治五年（1648），真寧知縣焦象賢申請(qǐng)，并21里為7里，即：與新、光化、挈炬、和恒、金湯、靈湫、永綏7里，共編為68甲。康熙八年（1669），析陜西行省甘肅布政使司置甘肅行省，真寧屬甘肅行省慶陽(yáng)府。雍正元年（1723），因避清世宗“胤礻真 ”諱，更名真寧縣為正寧縣。

民國(guó)和陜甘寧邊區(qū)時(shí)期（1911——1949）     

民國(guó)初，正寧縣治仍在羅川，正寧縣先后屬隴東道和涇原行政區(qū)。民國(guó)18年（1929），縣長(zhǎng)李劍泉被饑民所殺，縣治遷至山河。當(dāng)時(shí)全縣轄山河、永和、羅川3區(qū)42個(gè)行政村。民國(guó)22年，改區(qū)公所為鎮(zhèn)公所。民國(guó)25年，民國(guó)政府廢涇原行政區(qū)，設(shè)立甘肅省第三行政督察專員公署，正寧縣屬之。同年，又改鎮(zhèn)公所為區(qū)公署。區(qū)下為聯(lián)保，聯(lián)保下為保，保下為甲。全縣共轄3區(qū)6聯(lián)保46保492甲。

1932年4月，劉志丹、謝子長(zhǎng)率領(lǐng)陜甘游擊隊(duì)在正寧縣寺村塬建立了陜甘邊區(qū)的第一個(gè)臨時(shí)革命政權(quán)——寺村塬革命委員會(huì)。1934年11月，共產(chǎn)黨在正寧縣成立了南區(qū)革命委員會(huì)。1935年初因戰(zhàn)爭(zhēng)原因，南區(qū)革命委員會(huì)和正寧縣辦事處暫駐陜西省中部縣小石崖村。1935年7月，南區(qū)革命委員會(huì)和正寧縣辦事處機(jī)關(guān)遷駐正寧縣三嘉塬。9月，成立南區(qū)蘇維埃政府和新正縣革命委員會(huì)，兩機(jī)關(guān)移駐五頃原南邑村。11月，南區(qū)蘇維埃政府改為關(guān)中特區(qū)蘇維埃政府。1937年10月，關(guān)中特區(qū)改為關(guān)中分區(qū)督察專員公署，新正縣蘇維埃政府改為新正縣抗日民主政府，屬關(guān)中分區(qū)管轄，兩機(jī)關(guān)合署辦公，前后駐南邑村2年零3個(gè)月。此后，兩機(jī)關(guān)移駐新正縣三區(qū)八鄉(xiāng)馬家堡。當(dāng)時(shí)，新正縣共轄6區(qū)42鄉(xiāng)：一區(qū)轄今湫頭、五頃原等9個(gè)鄉(xiāng)；二區(qū)轄今三嘉、關(guān)川等6個(gè)鄉(xiāng)；三區(qū)轄長(zhǎng)舌頭等8個(gè)鄉(xiāng)（今屬陜西省旬邑縣）；五區(qū)轄今永正、榆林子長(zhǎng)樂(lè)地區(qū)7個(gè)鄉(xiāng)；六區(qū)轄底廟等5個(gè)鄉(xiāng)（今屬陜西省彬縣）。同年，解放區(qū)新寧縣抗日民主政府在今正寧縣月明鄉(xiāng)楊園子成立，西坡、月明等鄉(xiāng)歸屬新寧縣管轄。 

1937年1月，國(guó)民黨正寧縣政府同新正縣抗日民主政府進(jìn)行談判，劃分臨時(shí)縣界。新正縣政府作出讓步，將第五區(qū)全部劃給國(guó)民黨正寧縣政府。從此，新正縣轄區(qū)由6個(gè)區(qū)減為5個(gè)區(qū)，鄉(xiāng)政府合并為28個(gè)。

1940年，國(guó)民黨政府改區(qū)為鄉(xiāng)鎮(zhèn)，取消聯(lián)保。國(guó)民黨正寧縣政府時(shí)有山河、永和、羅川、平子4鎮(zhèn)及永正、紀(jì)綱2鄉(xiāng)，下轄46保496甲。

1946年，國(guó)民黨正寧縣政府增設(shè)三嘉、月明2鄉(xiāng)和湫頭鎮(zhèn)，因地域分屬新正縣和新寧縣，故將月明鄉(xiāng)僑置山河鎮(zhèn)，將三嘉鄉(xiāng)和湫頭鎮(zhèn)僑置永和鎮(zhèn)。

1948年，國(guó)民黨正寧縣政府仍轄山河、永和、羅川、平子4鎮(zhèn)及永正、紀(jì)綱2鄉(xiāng)，下屬56保。

1949年4月，關(guān)中分區(qū)更名為三原分區(qū)，新正縣、新寧縣屬之。同年5月，國(guó)民黨正寧縣自衛(wèi)隊(duì)在雷鴻軒、先子靈率領(lǐng)下宣布武裝起義，縣長(zhǎng)馬守禮被押送解放區(qū)。6月初，自衛(wèi)隊(duì)一部又叛逃到平子鎮(zhèn)，國(guó)民黨第三督察專員公署借機(jī)在平子鎮(zhèn)恢復(fù)了國(guó)民黨正寧縣政府。同年6月，解放區(qū)隴東分區(qū)和三原分區(qū)負(fù)責(zé)人在陜西三原開(kāi)會(huì)，決定撤銷(xiāo)新正和新寧縣建置，恢復(fù)正寧縣和寧縣，并將兩縣歸屬隴東分區(qū)。會(huì)議還決定將原寧縣管轄的宮河鎮(zhèn)及米橋鄉(xiāng)2個(gè)保劃歸正寧縣，將原正寧縣管轄的平子鎮(zhèn)劃歸寧縣。原新寧縣管轄的西坡、月明地區(qū)劃歸正寧縣。原新正縣管轄的湫坡頭、職田、底廟分別劃歸陜西省旬邑縣、分阝 縣。7月26日，經(jīng)中共西北中央局批準(zhǔn)，隴東分區(qū)改稱慶陽(yáng)分區(qū)，正寧縣屬之。

中華人民共和國(guó)時(shí)期（1949年至現(xiàn)在）     

1949年7月27日，正寧縣解放。新成立的正寧縣人民政府從原新正縣三區(qū)駐地陽(yáng)坡頭村遷往永正。在永正討論商定了對(duì)全縣新解放區(qū)的接收工作。8月8日，縣政府機(jī)關(guān)進(jìn)駐山河城。從此，山河成為正寧縣政治、經(jīng)濟(jì)、文化活動(dòng)的中心。

1949年至1952年，正寧縣轄三嘉、湫頭、永和、西坡、永正、羅川、宮河7個(gè)區(qū)、47個(gè)鄉(xiāng)、165個(gè)行政村、439個(gè)自然村。